Pyrenéerna veckades huvudsakligen under den alpina bergskedjebildningen. Geologiskt kan Pyrenéerna indelas i en nordlig och en sydlig zon med sedimentära bergarter samt en centralzon med kristallina skiffrar och graniter. Pyrenéernas högsta toppar finns i Maladettabergen i centralzonen, högst är Pico de Aneto (3 404 m ö.h.). De högre liggande delarna av Pyrenéerna