SCO har sina rötter i sammanslutningen Shanghai Five, som grundades vid ett möte 1996 mellan ledarna för Kazakstan, Kina, Kirgizistan, Ryssland och Tadzjikistan. Syftet med samarbetet mellan dessa fem stater var i första hand att lösa gränsfrågor som uppstod efter Sovjetunionens upplösning, då Kina fick tre nya centralasiatiska grannstater. Sedan 1996