I samband med ändrad organisation av den psykiatriska vården övertogs sjukhuset 1967 av landstinget från staten. När nya behandlingsmetoder infördes, minskade vårdbehovet och patienterna överfördes successivt till Sundsvalls lasarett. Under 1999 avvecklades all psykiatrisk verksamhet vid Sidsjöns sjukhus då den nya rättspsykiatriska regionvårdsenheten i Nacksta öppnade.