Slemhinnor täcker kroppshålornas väggar, de inre organens ytor samt väggarna i de olika rörformiga organen, bland annat matsmältnings- och andningsorganen. Slemhinneytan hålls fuktig av slem som produceras av slemkörtlar, vilka mynnar på ytan. I vissa organ (andningsorganen och äggledarna) är slemhinnan försedd med cilier.