Sedan 1910-talet har genkartor upprättats för olika organismer, t.ex. bananfluga, majs och mus, genom analys av egenskapskombinationer i avkomman efter korsningar där föräldrarna skiljer sig i två eller flera genloci. Hos bakterier, som har endast en kromosom, kan kartering även ske med hjälp av genöverföring (t.ex. konjugation) mellan två genetiskt