Genom G. sker utflödet av vatten och is från Polarbassängen söderut via Grönlandsströmmen. Varmare och saltare atlantvatten tillförs G:s östra del. I samband med vinterns avkylning och isbildning sjunker detta vatten och utgör kärnan till det djupvatten som ventilerar oceanernas inre, varigenom förhållandena i G. kan påverka det globala klimatet.