Med metoden kan specifika RNA-molekyler påvisas i en vävnad och deras längd och relativa mängd kan bestämmas. Metoden bygger på elektroforetisk storleksseparation av RNA-molekyler, överföring av molekylerna till ett membran och därefter påvisande av specifika RNA-molekyler med hjälp av s.k. sökfragment som är märkta (med radioaktiva isotoper eller på annat