Strukturen för en bakteriell proteasom (hos Thermoplaʹsma acidoʹphilum) har bestämts. Den utgörs av 28 polypeptider som tillsammans bildar ett rör genom vilken polypeptiden som skall brytas ned förs. Inte alla proteiner bryts ned av proteasomer; i eukaryota celler bara de som är märkta med proteinet ubikvitin. I bakterier transporteras de