Alejandro Giammattei arbetade efter avslutad läkarexamen för en internationell hälsoorganisation. Efter att under 1980- och 90-talen varit verksam inom offentlig förvaltning utnämndes Giammattei 2005 till chef för landets fängelser, ett uppdrag han hade fram till 2007. Alejandro Giammattei har också arbetat som finanskonsult åt privata företag.