Magnus arbetade på Berzelius laboratorium 1827–28, där han bl.a. framställde platinaföreningen ”Magnus gröna salt”, den först kända ammoniakkomplexföreningen (tetraamminplatina(II)-tetrakloroplatinat(II )). Han upptäckte perjodsyra 1833, vars salter han studerade, och utarbetade nya metoder för bestämning av syre och koldioxid i blod. Som fysiker är Magnus känd för noggranna bestämningar av gasers