Efter studier i Köln och Rom blev Trolle domprost i Linköping 1513 och ärkebiskop 1514. Han sökte fullfölja företrädarnas roll som ledare för en unionsvänlig och rådskonstitutionalistisk politik men råkade omgående i konflikt med riksföreståndaren Sten Sture d.y. Från hösten 1516 belägrade denne Trolle på borgen Almarestäket, som trots försoningsförsök