Kunskaper om de egenskaper hos mikroorganismerna som är av betydelse för deras förmåga att orsaka sjukdom samt de som möjliggör förebyggande behandling (vaccination) eller behandling med antimikrobiella läkemedel är centrala inom området. Ämnesområdet innefattar också kunskaper om våra försvarsreaktioner mot angripande mikroorganismer. Jämför immunologi, klinisk bakteriologi och klinisk virologi.