pepsiʹn (av grekiska peʹpsis ’matsmältning’, av peʹssō ’göra mjuk’, ’koka’; ’smälta maten’), ett enzym med molekylmassan 34,6 kDa, vilket är aktivt i sur miljö (pH-optimum 1,5–2,0), och som spaltar peptidbindningar i proteiner vilka innehåller aminosyror med aromatiska sidokedjor.